「因为小智要找到当初立志成为宝可梦训练家的那份心情。」大木博士解释道。
「那么各位，这一次我要一个人去了。明天一早我就回来。」
巫马看着小智带着最初的宝可梦们一起向着山上走去，心中有些触动。
他最初的那些同伴很久都没有出来过了。不过巫马相信，要不了多久他就能够放弃伪装，重新拥有巫马这一个身份。到那时，他的所有精灵都可以一起登场了。
第二天一早，小智回来了。和他一起过来回来的，还有神代。
他们在山上的时候相遇了，所以就一起回来。
「欢迎回来！」
大家一起欢迎着小智和神代的回归。
巫马发现小智确实有些不一样了，这次说不定可以赢哦。
大木博士：「看样子最后的挑战就要来临了。」
「是啊！」小智充满了信心。
一旁的亚希达说道：「小如果打赢了神代，小智你也会成为开拓之脑的候补人选哦。」
「开拓之脑的候选人？」小智不太明白。
「原来我还没有跟你说过这件事啊。」亚希达忽然反应过来。
亚希达
「现在告诉你倒也不迟到啦。称霸对战开拓区的训练家就可以登堂入室，被正式认定为开拓之脑的候补人选。所以我一旦发现有前途的训练家，就会邀请他们来参加对战开拓区的比赛。」
「可是为什么是你在找人呢？」小智问道。
「因为我就是开拓对战区的负责人啊！」
「完全看不出来耶。」小智惊讶地说道。
「是这样的，我想拓展宝可梦对战的各种可能性，所以就设立了各种各样的对战设施。」
「那么，要是小智成为开拓之脑的话，就可以主持对战设施吗？真的太酷了！」小胜说道。
「是这样的。不过现在对战设施暂时饱和了，如果没有人退出的话，一直都只能当候选人呢。」
「可是能够打败神代先生的训练家可不多吧。」巫马说道。
「不管怎么样，我都一定要打败神代先生。」小智非常兴奋地说道。
大家进入对战金字塔。小智与神代的对战即将开始了。这一次，他们将采取更为全面的四对四的战斗。
巫马很期待，神代这一次会派出怎样的宝可梦。
裁判：「那么，现在对战金字塔的开拓对战赛正式。开始对战的双方是来自真新镇的小智以及对战金字塔的开拓之脑神代。这一次的比赛采用4比4的淘汰赛，只有挑战者可以替换使用的宝可梦。请开拓之脑先拿出宝可梦。」
「去吧，夜巨人。」
让巫马有些意外的是，神代并没有派出三神柱中的任何一个，而是派出了夜巨人。不过夜巨人确实也很符合神代这种经常探险各大遗迹的训练家。
「喷火龙，就决定用你了。」
小智直接派出发喷火龙。
「喷火龙，使用喷射火焰。」
喷火龙喷出了强大的火焰，巫马能够感觉到他的火焰比上一次见到的时候要强大很多。
「夜巨人，使用鬼火。」
夜巨人释放了蓝色的鬼火，将喷射火焰挡了下来。用威力低一点的鬼火就能够挡住喷射火焰，神代的这只夜巨人不可小觑。
「喷火龙，使用钢翼绝招。」
喷火龙使出钢翼，加快速度向着夜巨人冲过去。
「夜巨人，使用影子拳。」
影子般的拳头快速地打在了喷火龙的身上。
喷火龙被攻击之后，非常地生气。
「把你的怒气发泄出来吧。喷火龙，使用龙息绝招！」
喷火龙对着夜巨人使出了威力强大的龙吸。龙吸命中了夜巨人，造成了不小的伤害。
「夜巨人，使用黑色眼光。」
夜巨人施展出黑色眼光，命中了喷火龙。这样一来，小智就没办法替换喷火龙了。
在这之后，神代必须想办法衔接其他的绝招，不然这一招并没有实际的意义。
「喷火龙，使用钢翼绝招。」
小智还是打算采取近身攻击的方式，让喷火龙向着夜巨人冲过去。
有些奇怪的是，神代并没有指挥夜巨人使出任何的绝招。钢翼命中了夜巨人。
「使出奇异光线。」
趴在喷火龙翅膀上的夜巨人，近距离地使用了奇异光线，瞬间命中了。
被奇异光线命中后，喷火龙混乱了。
原来如此，神代让夜巨人承受钢翼的伤害，就是为了使奇异光线能够绝对的命中。
「喷火龙，回来吧。」
小智准备将喷火龙收回来，这样就可以解除混乱状态了。但小智的行动失败了，因为夜巨人之前对着喷火龙使用了黑色眼光。大家也都明白，神
代之前为什么会使用那一招了。
喷火龙彻底的混乱了，完全听不到小智的命令。
「喷火龙，振作起来呀。」
喷火龙一时之间没办法清醒。神代可不会放掉这个好不容易才创造出来的机会。
「夜巨人，使用影子拳。」
影子拳命中了喷火龙，将喷火龙打了出去。
「夜巨人，使用鬼火。」
鬼火同样命中了喷火龙，持续的对喷火龙造成伤害。
「喷火龙，快点清醒过来呀！我相信你一定可以的。」
在小智的呼喊声中，喷火龙终于清醒了过来。
「很好，使用龙吸。」
喷火龙施展出龙息，命中了夜巨人。不过神代的这只夜巨人可没有想象的那么脆弱。
「夜巨人，使用鬼火。」
夜巨人都鬼火再次命中了喷火龙。虽然火焰系的绝招对喷火龙来说效果不是很明显，但也能够对他造成伤害。
「喷火龙，使用钢翼绝招。」
喷火龙再度向着夜巨人冲过去。
和之前一样击中了夜巨人，而夜巨人还是一样的挂在喷火龙的身上。
「既然这样，就直接使用地球上投。」
这一次，小智做了转变。
喷火龙抱着夜巨人，快速地向下方坠落。
然而这时，夜巨人忽然挣脱了。小智这才想起来，格斗系的绝招对幽灵系的夜巨人来说是没有作用的。
「使用影子拳。」
夜巨人的影子拳打在了喷火龙的身上。喷火龙快速地向地面落去，砸在了地上。
喷火龙由于受伤过于严重，失去了战斗能力。
小智本来以为自己用强大的喷火龙能够拿下第一场的胜利，没想到还是输掉了。